Неврологическое отделение (детей) с медицинской реабилитацией и дневным стационаром принимает пациентов с эпилепсией, орфанными заболеваниями (наследственные нервно-мышечные заболевания, в том числе прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна, синдромальная патология), также в отделении проводится реабилитация детей с двигательными нарушениями (ДЦП, последствия травм, инсультов, нейроинфекций).

В отделении применяется современная программа ведения пациентов с эпилепсией, включающая проведение длительного от часа и более (с возможностью многосуточного) видео ЭЭГ мониторинга, с регистрацией клинических событий, МРТ головного мозга по эпипрограмме на аппарате МРТ 3,0 Тл, с анестезиологическим пособием для детей, начиная с раннего возраста.

В отделении проводится реабилитация детей с применением высокотехнологичного реабилитационного оборудования, в том числе с использованием принципов БОС (Экзарта, Tymo, Pablo, стабилоплатформа, Galileo, Орторент Моторика, Корвит, Artromot, нагрузочные костюмы Адели, Атлант). Также организованы занятия по индивидуальной кинезиотерапии с врачами-реабилитологами и инструкторами ЛФК, консультация и занятия с нейропсихологом, логопедом, дефектологом. Для пациентов с нервно-мышечными заболеваниями доступна игольчатая миография, УЗИ нервов, МРТ мышц на аппарате МРТ 3.0 Тл.